Цукуне Аоно, обычный школьник, по воле случая оказывается зачисленным в Призрачную академию, учебное заведение для самых разных монстров. Не подозревая об этом, он изначально собирается поступать в обычную школу, но ошибка в документах приводит его в мир, населённый существами из ночных кошмаров и мифов. Оказавшись в таком необычном месте, Цукуне быстро осознаёт опасность своего положения и планирует сбежать, осознавая, что вокруг него не просто мирные студенты, а потенциальные угрозы.
Однако его планы резко меняются, когда он встречает Моку Акасию, красивую и добродушную девушку, которая сразу привлекает его внимание. Мока оказывается дружелюбной и приветливой, и Цукуне, обессиленный чарами её улыбки, забывает о страхах и планах бегства. Присутствие Моки не только дарит ему спокойствие, но и заставляет его желать остаться рядом с ней, несмотря на все опасности, которые таит в себе академия.
Постепенно Цукуне узнаёт, что Мока – не обычная девушка. Её истинная природа раскрывается, когда с её груди снимают чётки, и тогда она превращается в высшего вампира, существо с впечатляющей силой и могуществом. Этот факт вызывает у Цукуне сначала шок и тревогу, но затем он понимает, что его чувства к Моке остаются неизменными, даже несмотря на её вампирическую сущность.
Мока в её человеческой форме и Мока-вампир – это две разные личности, и Цукуне принимает обе стороны её характера. Он решает остаться в академии, чтобы быть рядом с ней и справиться с любыми трудностями. Их отношения развиваются на фоне множества приключений и встреч с другими монстрами, которые учатся в академии. Цукуне и Мока не только сталкиваются с опасностями, но и строят крепкую дружбу, которая постепенно перерастает в нечто большее, преодолевая различные испытания и преодолевая предубеждения со стороны окружающих.
В итоге, Цукуне обнаруживает, что попав в Призрачную академию, он обрел нечто большее, чем просто пугающий опыт: он нашел друзей, любовь и понял, что даже в самом жутком месте можно найти свет и надежду.
